參拜貴船神社，乃自古以來信仰水之女神的「貴船信仰」神社之總本宮，廣受人民崇拜。
據說，貴船神社在古墳時代已鎮坐於貴船川上游。
「貴船(きふね)」的由來，出自創建神社的傳說，神武天皇之母玉依姫命，現身於浪花之津(大阪灣)。
乘著「黃色的(きいろい)」船(ふね)，時而溯淀川前往鴨川，時而停留在更上游的水源湧出之處。
據說，那就是現在貴船神社的奧宮所在的位置附近。
當時神武天皇之母玉依姫命在停留處，下達神諭：「在有船停靠的地方建立社殿，
尊水源神為祭神好好祭祀，國土就能豐饒，位人民帶來福運」
玉依姫命所乘的「黃色的(きいろい)」船(ふね)，就成了「貴船(きふね)」命名之由來。
一如神社創立的傳說所記載，原本的鎮坐地應是奧宮。天喜三年(西元1055年)遷宮到現址，直到現在。
平安京遷都後，貴船神社成為守護京都的守護神，名列社格最高的「名神大社」，與賀茂社齊名。
貴船神社也以繪馬發祥地而著名。自古以來便是祈雨神社，歷代天皇都曾到此祈願。
自古以來，馬一直被視為神之坐騎。 這種觀念不僅日本獨有，在歐洲與中亞一帶也非常普遍。
基於上述理由，人們開始將「奉獻馬給神當坐騎」視為一種風俗習慣，尤其是為了祈雨來奉納活馬。
然而真正的馬其實是很貴的，別說庶民買不起，就算是有錢人也不見得有那個閒錢。
結果，人們改用人造的假馬(銅馬)或是繪馬來獻神。
貴船神社主祭神
貴船神社之主祭神為「高龗神（たかおかみのかみ）」，為司掌水之龍神。
據《日本書紀》第七個一書記載：伊奘諾尊拔劍，斬軻遇突智(カグツチ火燄之神靈)為三段。
其一段是為「雷神(いかづちのかみ)」、 一段是為「大山祇神(おほやまつみのかみ)」。
一段是為「高靇(たかおかみ)」、也就是由頭部化「雷神」，上身化為「山神」，下體化為「雨水之神」。
雨水之神從下體化出，可聯想與排尿之關聯，而貴船神社則解釋為鎮止火神而產生水神。
又，奧宮祭神另一說為「闇靇神(くらおかみ)」。
依《日本書紀》第六個一書伊奘諾尊以十握劍斬軻遇突智，從劍尖垂血激越為神－
先後產生三神「闇靇(くらおかみ)」、「闇山祇(くらやまつみ)」、「闇罔象(くらみつは)」。
闇山祇所指為「深闇淵谷」之神，即《古事記》所記載從火神下陰(ほと)所化生的「闇山津見神」。
「闇罔象(くらみつは)」為深闇淵谷之水神，其他記載則是從女神イザナミ之尿液產生「罔象女神」，
在水神宗社丹生川上神社即祭祀「罔象女神」，奉為司掌水與雨之神，而向其祈雨或是止雨。
「闇靇(くらおかみ)」是深闇淵谷之雨水神，
《古事記》記載「闇淤加美神」為十握劍劍柄之血從伊邪那岐"指縫"漏出所生。
「靇(おかみ)」則是與雨和水有關的「龍蛇神」。
見《豊後国風土記》記載:『球覃鄉.在郡北.此村有泉.同天皇,行幸之時,奉膳之人,
擬於御飲, 令汲泉水,即有蛇靇(おかみ).謂-於箇美.即,おかみ.
於茲,天皇敕云:「必將有臭.莫令汲用.」因斯名曰-臭泉 （くさいずみ）,
因為村名.今謂-球覃（くたみ）鄉者,訛也』又此敘述聯想到「臭蛇（シュウダ）」，
遇到嚇時會從肛門腺分泌出帶有臭味的液體來嚇跑敵人，即我們台灣俗稱的臭青母。
所以「闇靇(くらおかみ)」就是深闇淵谷的龍蛇神，「高靇(たかおかみ)」的高(たか)則指強猛(たけ)。
貴船神社自古將「闇靇」與「高靇」視為同一神，因此祭神即為「闇谷的荒暴強猛之龍神」。
另外，在《古事記》記載建御雷神為十拳劍斬殺カグツチ，劍身之血灑落淨石群中，因而化生之神，
斬火神之十拳劍，名天之尾羽張，亦名伊都尾羽張，建御雷神被視為天之尾羽張之子。
貴船神社則將「高龗神」視為イザナギ之子。
此外，在《古事記》記載「淤迦美(おかみ)神」即「靇(おかみ)」之女兒為「日河姫(ひかわひめ)」。
「日河姫(ひかわひめ)」為河川女神，由於「日河(ひかわ」與出雲大川「肥河(ひかわ)」之同音，
認為是與出雲之肥河(斐伊川)有關之女神，亦或是「日(ひ)」所指為「靈(ひ)」之意。
又，從八岐大蛇蛇尾所得到的「草薙劍（くさなぎのつるぎ）」，
亦有解釋「くさ」為「臭」的意思，至於「なぎ」則為「蛇」的意思。
不過「臭（くさ）」亦有令人不快、棘手之意。
另一方面，河面也會映照太陽的鏡像，如八咫鏡一樣，所以寫成「日河（ひかわ）」。
也可以如此思考「日(ひ)」所指為「靈(ひ)」之意而「ひかわ」泛指「河川崇拜」，
無論農耕、砂鐵鍊鐵、生活用水都與河川息息相關而為「ひのかわ（靈川）」。
貴船神社結社之磐長姫
貴船神社之結社的主祭神為磐長姫(イワナガヒメ)命作為縁結びの神。
磐長姫命是木花開耶姬的姊姊。 當天孫瓊瓊杵尊選擇木花開耶姬當妻子時，
這對姊妹的父親希望他也同時娶姊姊。 但瓊瓊杵尊表示一個即以足夠，予以婉拒。
磐長姫命感到羞恥， 因而立誓發願，立志促成婚姻的結緣神。終身為他人服務。
