分子科學的核心課程分成五種類型
其中前三種就是物理化學核心內容(物理化學之四大力學)所涵蓋的內容，第四種是應用部分，第五種則是擴展到生科領域的科目。
(1)量子化學/量子力學/計算化學 :物理化學之四大力學的量子力學
- 量子化學
Szabo的量子化學是計算化學必讀之書。
- 量子力學
Cohen的量子力學是AMO的必備!
計算化學
(2)熱力學/統計熱力學 :物理化學之四大力學之二的化學熱力學與統計力學
(3)化學動力學/高等化學動力學/分子模擬態動態學/物化特論──反應動態學 :物理化學之四大力學之的化學動力學
(4)物理化學研究技術/雷射化學/超快化學/分子光譜/光化學原理:物理化學四大力學的應用
分子光譜與光化學原理、固態化學、自旋動力學
(5)物理化學擴展到生科領域:神經動力學
