在金剛頂瑜伽密教中，蓮華部屬於六大中的火大，顏色為紅蓮色，即「所謂蓮華性即愛染性」而為「大愛染慈悲」，火大乃「調和制伏」而如《最上根本大樂金剛不空三昧大教王經》所云『離慾調世間，未為清淨法，云何清淨法，謂大慾大樂』因此蓮華部即以大愛染慈悲來調和制伏世間，如妙色紅蓮華不染煩惱塵垢得自性清淨法性，如《一切佛攝相應大教王經剩觀自在菩薩念誦儀軌》之偈誦云『譬如清淨妙色蓮，雖生泥中不可染，如是眾生處煩惱，悉得清淨於三界』。
(上圖為蓮華部母・法波羅蜜多即法金剛女菩薩)
金剛頂瑜伽密教之初會『一切如來真實大乘現證大教王』之<遍調伏品>即開顯大愛染慈悲調和制伏世間的蓮華部法，唐密祖師不空阿闍黎所譯的《都部陀羅尼目》云：「瑜伽部曼茶羅有四。一金剛界、二降三世、三遍調伏、四一切義成就。此四曼茶羅，表毘盧遮那佛內四智菩薩，謂金剛灌頂蓮花羯磨為四智， 又四智謂大圓鏡平等性妙觀察成所作為四智矣」，可知<遍調伏品>表示蓮華部母・法波羅蜜多(法金剛女)之蓮華智，蓮華部母・法波羅蜜多(法金剛女)之偈誦云: 「大哉一切正覺尊，大法金剛我清淨，由本自性清淨故，令諸愛染悉無垢」如此於<遍調伏品>之法三昧耶秘密智印即云「觀想蓮華善愛者，金剛杵在蓮華上，金剛蓮華勝合時，善愛清淨得成就」此亦金剛蓮華二法和合相應成就。所以唐密祖師不空阿闍黎所傳之《毘那夜迦誐那鉢底瑜伽悉地品祕要》中觀自在菩薩以妙女身調和制伏毘那夜迦，即是大愛染慈悲調和制伏世間的蓮華部法，又此男女合和(Mithuna)尊即稱歡喜自在天，其造相有象頭神抱女天，亦有天人形象之夫婦相擁，男天即金剛手普賢，女天即蓮華手觀自在，這即與《佛說祕密相經》相應。
《佛說祕密相經》乃源自金剛頂瑜伽密教初會『一切如來真實大乘現證大教王』之觀自在菩薩、虛空藏菩薩等三十七尊皆為女尊的『金剛秘密曼荼羅』所發展而來，因此《佛說祕密相經》的五部大明皆取自『金剛秘密曼荼羅』諸女尊的最上心明，偈誦云「偉大無上的菩提心，令一切眾生歡喜，，一切如來菩薩皆成為女尊，讓眾生不感到畏懼而順受調和制伏」因此如來部最上心明:『Oṃ vajradhātvīśvarī hūṃ vajriṅī』;金剛金剛部最上心明:『Oṃ vajravajriṅī hūṃ』;寶部最上心明:『Oṃ ratnavajriṅī hūṃ』;蓮華部最上心明:『Oṃ dharmavajriṅī hūṃ』;羯磨部最上心明:『Oṃ karmavajriṅī hūṃ』。
(金剛秘密曼荼羅中妙女身之蓮華手觀自在菩薩)
蓮華手觀自在菩薩為妙女尊而成就「秘密金剛法智蓮華愛染之三昧耶」，因此在《佛說祕密相經》中「大日如來告聖觀自在菩薩摩訶薩言，即汝蓮華手是名為蓮華」所謂「蓮華」即「女陰」，「男根」則為「金剛杵」，因此在《佛說祕密相經》女尊觀自在菩薩即說「所有金剛杵住於蓮華上，彼金剛杵及與蓮華，二法和合相應成就，獲得妙樂無滅無盡」金剛杵及與蓮華二法和合即男女相媾相應成就，開顯金剛杵住蓮華上之秘密相(即男女相媾)，如《佛說祕密相經》云「金剛及彼蓮華二事相擊， 成就二種清淨乳相，一謂金剛乳相，二謂蓮華乳相。由此出生一切賢聖，成就一切殊勝事業」、金剛杵開覺蓮華而得開覺女尊云「快哉一切正覺尊，我所敬愛施妙樂，唯此妙樂外無餘，而能成就祕密法」。因此，蓮華部法即為將男女夫妻的愛情生活成為遍調伏世間障礙的無上妙樂自性清淨法。
